Biologia Computazionale
Responsabile Scientifico: Prof. Paolo Provero
Componenti gruppo di ricerca:
- Paolo Provero (Responsabile Scientifico)
- Davide Marnetto (Assistant professor, RTDA)
Indirizzo e contatti:
- Paolo Provero (011 670 6438, paolo.provero@unito.it)
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Principali attività del gruppo di ricerca
La nostra attività di ricerca si concentra su diversi aspetti della regolazione genica. Da un lato, siamo interessati all'evoluzione e alla variazione degli elementi regolatori nel genoma umano. Dall'altro, stiamo lavorando per l'integrazione dell'espressione genica predetta geneticamente nello studio dei tratti complessi derivati da neuropsichiatria e neuroimaging.
L'unità collabora inoltre con diversi laboratori sperimentali fornendo competenze di bioinformatica e data mining.
Lista delle 10 principali pubblicazioni
- Lanciano T, Savino A, Porcu F, Cittaro D, Bonchi F, Provero P. Contrast subgraphs allow comparing homogeneous and heterogeneous networks derived from omics data. Gigascience. 2022;12:giad010.
- Jagoda E, Marnetto D, Senevirathne G, et al. Regulatory dissection of the severe COVID-19 risk locus introgressed by Neanderthals. Elife. 2023;12:e71235.
- Draetta EL, Lazarević D, Provero P, Cittaro D. The frequency of somatic mutations in cancer predicts the phenotypic relevance of germline mutations. Front Genet. 2023;13:1045301.
- Moiso E, Provero P. Cancer Metabolic Subtypes and Their Association with Molecular and Clinical Features. Cancers (Basel). 2022;14(9):2145.
- Marnetto D, Pankratov V, Mondal M, et al. Ancestral genomic contributions to complex traits in contemporary Europeans. Curr Biol. 2022;32(6):1412-1419.e3.
- Marnetto D, Pärna K, Läll K, et al. Ancestry deconvolution and partial polygenic score can improve susceptibility predictions in recently admixed individuals. Nat Commun. 2020;11(1):1628.
- Mariella E, Marotta F, Grassi E, Gilotto S, Provero P. The Length of the Expressed 3' UTR Is an Intermediate Molecular Phenotype Linking Genetic Variants to Complex Diseases. Front Genet. 2019;10:714.
- Marnetto D, Mantica F, Molineris I, Grassi E, Pesando I, Provero P. Evolutionary Rewiring of Human Regulatory Networks by Waves of Genome Expansion. Am J Hum Genet. 2018;102(2):207-218.
- Grassi E, Mariella E, Lembo A, Molineris I, Provero P. Roar: detecting alternative polyadenylation with standard mRNA sequencing libraries. BMC Bioinformatics. 2016;17(1):423.
- Marnetto D, Molineris I, Grassi E, Provero P. Genome-wide identification and characterization of fixed human-specific regulatory regions. Am J Hum Genet. 2014;95(1):39-48.